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Hans Johannes Gottfried Hallier (Jena, 6 de julio de 1868 – Oegstgeest, 10 de marzo de 1932) fue un botánico alemán.
Estudia botánica y zoología en la Universidad de Jena con Christian Ernst Stahl (1848-1919) y con Ernst Haeckel (1834-1919), continuando sus estudios en la Universidad de Múnich con Ludwig Radlkofer (1829-1927) y con Richard Hertwig (1850-1937).
De 1893 a 1897 trabaja en el Jardín Botánico de Buitenzorg de Java, para ser luego asistente al "Instituto Botánico" de la Universidad de Múnich, y a comienzos de 1898 trabaja en el "Museo Botánico de Hamburgo.
De 1903 a 1904 participa de una expedición científica a India, Ceilán y el Archipiélago malayo. Publica varias obras en relación con la flora de las Indias Orientales Neerlandesas, incluyendo tratados de la flora de Borneo.
De 1908 a 1922, Hallier es curador del Rijksherbarium en Leiden. Es recordado aún por intoducir una clasificación filogénica de fanerógamas: sistema Hallier.[1][2]